138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0671 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
371 aa  766    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  43.24 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  41.98 
 
 
371 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  38.27 
 
 
370 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  40.54 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  34.79 
 
 
374 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  29 
 
 
394 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  28.92 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.2 
 
 
371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  29.35 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  27.4 
 
 
368 aa  123  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  28.93 
 
 
362 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  29.53 
 
 
355 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  29.53 
 
 
355 aa  117  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  26.92 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  25.21 
 
 
386 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  25.75 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.37 
 
 
349 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  27.25 
 
 
359 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  24.8 
 
 
380 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  27.58 
 
 
354 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  27.25 
 
 
373 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  27.52 
 
 
381 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  26.8 
 
 
383 aa  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.16 
 
 
383 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  25.97 
 
 
352 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  23.04 
 
 
392 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  24.66 
 
 
360 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  23.51 
 
 
388 aa  99.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  22.28 
 
 
387 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  28.11 
 
 
381 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  25 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  26.03 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  26.58 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  23.31 
 
 
380 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  26.24 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.43 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  23.71 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  26.16 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  26.86 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.55 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  26.03 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  26.33 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  25.4 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  26.58 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  24.48 
 
 
396 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  22.89 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  25.75 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  26.05 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  25.2 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.49 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  23.6 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  22.49 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  21.04 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  22.19 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  22.59 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  24.93 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  24.79 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  22.25 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  25.07 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  24.44 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  25.47 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  25.18 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  24.65 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  22.59 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  24.52 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  25.63 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  22.07 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  22.49 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  22.07 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  23.3 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  23.16 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  21.96 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  23.04 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  20.22 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  23.89 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  23.31 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  23.71 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  21.89 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  23.4 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  22.85 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  21.59 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  21.89 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  22.54 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  29.74 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.97 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  21.39 
 
 
401 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  20.44 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  19.38 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.54 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  22.07 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  28.21 
 
 
426 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  28.21 
 
 
426 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  23.61 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  22.43 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  28.21 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  20.11 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  19.69 
 
 
425 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  19.69 
 
 
425 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  28.49 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>