141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3951 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  91.09 
 
 		 359 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  87.77 
 
 		 376 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  95.74 
 
 		 375 aa  727    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  86.7 
 
 		 376 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  80.32 
 
 		 376 aa  610  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  70.71 
 
 		 379 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  69.87 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  65.24 
 
 		 378 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  70.74 
 
 		 380 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  70.99 
 
 		 355 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  64.97 
 
 		 378 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  56.8 
 
 		 380 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  53.99 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  53.44 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  55.32 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  52.66 
 
 		 393 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  53.7 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  50.66 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  49.73 
 
 		 380 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  46.93 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  51.19 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  49.2 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  53.03 
 
 		 393 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  32.66 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  32.76 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  31.7 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  35.01 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  35.29 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  32.56 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  28.88 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  30.56 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  29.03 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  34.27 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  35.16 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  32.67 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  27.01 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  27.3 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  27 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  30.03 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  29.19 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  29.22 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  29.26 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  29.26 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  29.06 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  26.49 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  31.27 
 
 		 380 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  30.48 
 
 		 381 aa  115  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  29.39 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  29.68 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.72 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.56 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  27.11 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  30.88 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.65 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.62 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  28.03 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  25.79 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  29.57 
 
 		 359 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  28.35 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  24.47 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  25.73 
 
 		 371 aa  99.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.93 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  29.84 
 
 		 382 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.93 
 
 		 387 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.13 
 
 		 383 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  25.13 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.77 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  32.76 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.41 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  31.56 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  25.98 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  27.27 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  28.77 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  26.6 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  26.36 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  31.4 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  25.14 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  22.96 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  29.21 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  32.89 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  26.09 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  32.18 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  28.67 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  32.18 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  32.85 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  29.1 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  31.15 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  30.22 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  24.33 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  24.73 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  33.82 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  24.12 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  27.21 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  23.56 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  26.65 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  28.51 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  28.57 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  26.74 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>