74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35359 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  100 
 
 		 424 aa  871    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  58.25 
 
 		 424 aa  510  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  39.39 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  39.09 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  29.17 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  28.68 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  28.19 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  29.61 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  28.64 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  30.41 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  27.98 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  27.36 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  28.29 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  28.81 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  28.29 
 
 		 378 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  27.99 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  27.47 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  26.7 
 
 		 376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  27.01 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  27.01 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  27.12 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  28.68 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  27.67 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  27.85 
 
 		 384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  27.04 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  26.88 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  27.14 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  27.49 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  25.3 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  27.2 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  25.55 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  24.12 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  25.45 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  25.55 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  23.68 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  24.53 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  24.41 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  24.81 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  23 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  23.71 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  26.46 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  25.25 
 
 		 376 aa  67  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  24.11 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  24.08 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  22.68 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  22.68 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  22.13 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.31 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  22.89 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  23.65 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  21.08 
 
 		 360 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  25.87 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  23.14 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  21.17 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.84 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  22.46 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  24.14 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  22.77 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  23.27 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  23.92 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  24.49 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.58 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  22.93 
 
 		 359 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  21.9 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  25.26 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.73 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  22.47 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  23.3 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.75 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  22.75 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  22.93 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  22.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  23.17 
 
 		 382 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>