141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0971 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  74.27 
 
 		 384 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  70.74 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  70.74 
 
 		 376 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  71.01 
 
 		 375 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  68.68 
 
 		 378 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  67.63 
 
 		 378 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  69.71 
 
 		 376 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  69.17 
 
 		 376 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  68.87 
 
 		 379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  70.08 
 
 		 359 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  69.47 
 
 		 355 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  58.02 
 
 		 380 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  53.95 
 
 		 379 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  57.14 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  55.35 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  52.94 
 
 		 393 aa  346  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  49.6 
 
 		 380 aa  345  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  53.89 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  51.2 
 
 		 364 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  53.87 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  52.12 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  49.74 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  44.15 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  36.08 
 
 		 396 aa  185  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  34.63 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  33.15 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  33.8 
 
 		 366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  37.82 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  34.17 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  34.01 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  29.85 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  35.24 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  33.99 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  32.31 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  32.31 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  33.89 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  32.5 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  29.8 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  31.21 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  28.76 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  29.6 
 
 		 368 aa  127  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  31.9 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  32.18 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  29.34 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  32.81 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  32.58 
 
 		 356 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  34.17 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  31.44 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  27.35 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  28.09 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  27.86 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.65 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.2 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  29.59 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.08 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.37 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  26.4 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  27.51 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  27.25 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  25.66 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  33.06 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.44 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.44 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  28.92 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  31.03 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.06 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  27.17 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  32.52 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  26.69 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  31.7 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  26.71 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  32.64 
 
 		 383 aa  92.8  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  32.21 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  26.37 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  32.65 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  27.75 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  28.23 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  28.3 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  23.04 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  28.77 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.16 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  29.48 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  25.21 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  33.9 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  30.74 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  31.43 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  30.64 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  30.64 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.67 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  33.79 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  32.56 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  28.51 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  32.16 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  28.51 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  28.51 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  28.69 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  28.51 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>