157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6626 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  100 
 
 
366 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  90.44 
 
 
366 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  73.03 
 
 
366 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  53.98 
 
 
349 aa  358  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  53.12 
 
 
349 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  52.29 
 
 
351 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  50.29 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  49 
 
 
354 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  49 
 
 
355 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  49 
 
 
355 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  48.86 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  49.14 
 
 
360 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  48.58 
 
 
360 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  47.89 
 
 
356 aa  293  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  47.99 
 
 
359 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  46.4 
 
 
359 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  39.89 
 
 
372 aa  195  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  35.77 
 
 
371 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  36.39 
 
 
360 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  36.79 
 
 
386 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  36.24 
 
 
371 aa  176  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.55 
 
 
387 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  36.92 
 
 
360 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  32.98 
 
 
382 aa  170  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  34.86 
 
 
396 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  32.1 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  30.91 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  33.25 
 
 
388 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  35.13 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  34.63 
 
 
379 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  33.71 
 
 
376 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  32.43 
 
 
362 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  32.35 
 
 
387 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  31.34 
 
 
371 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  31.73 
 
 
372 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  34.82 
 
 
386 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.61 
 
 
387 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.94 
 
 
383 aa  159  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.68 
 
 
387 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  33.52 
 
 
376 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  32.64 
 
 
382 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  31.15 
 
 
384 aa  156  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  32.58 
 
 
376 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  33.14 
 
 
375 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  34.63 
 
 
380 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  32.55 
 
 
392 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  33.96 
 
 
368 aa  153  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  32.66 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  31.65 
 
 
378 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  31.79 
 
 
387 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  34.02 
 
 
355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  32.39 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  32.84 
 
 
359 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  31.37 
 
 
372 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  32.71 
 
 
383 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  29.78 
 
 
378 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  32.09 
 
 
393 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  30.93 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  30.08 
 
 
392 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  31.96 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  31.94 
 
 
383 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  34.09 
 
 
379 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30.5 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  31.67 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  33.16 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  31.28 
 
 
393 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  28.95 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  32.58 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  29.55 
 
 
400 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  31.96 
 
 
393 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  28.88 
 
 
364 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  31.25 
 
 
393 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  31.61 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  29.4 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  29.51 
 
 
417 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  29.29 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  27.76 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  31.68 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  29.36 
 
 
380 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.3 
 
 
376 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  26.9 
 
 
376 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  27.95 
 
 
388 aa  100  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  25.68 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  27.2 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  25.79 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  26.58 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  27.69 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  27.95 
 
 
447 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  25.59 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  27.12 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  26.54 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  28.01 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  26.12 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  26.67 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  35.88 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  26.43 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  27.12 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  27 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  26.78 
 
 
426 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>