89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63574 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  100 
 
 
424 aa  877    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  58.25 
 
 
424 aa  532  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  38.75 
 
 
419 aa  316  5e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  37.13 
 
 
414 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  30.07 
 
 
380 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  29.88 
 
 
379 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  29.83 
 
 
380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  29.85 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  28.01 
 
 
376 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  27.76 
 
 
376 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  30.6 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  29.48 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  28.92 
 
 
378 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  28.36 
 
 
393 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  27.92 
 
 
393 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  29.41 
 
 
355 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  28.64 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  30.7 
 
 
383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  27.56 
 
 
376 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  27.49 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  28.92 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  27.6 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  26.79 
 
 
388 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  27.02 
 
 
359 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  28.44 
 
 
393 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  27.71 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  26.94 
 
 
364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  26.17 
 
 
382 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  27.07 
 
 
396 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  26.83 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  25.67 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  26.1 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  23.82 
 
 
386 aa  86.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  24.5 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  27.07 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  26.01 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  24.17 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  23.92 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  24.21 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.42 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  25.67 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  25.67 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  24.94 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  24.03 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  23.32 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.63 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  24.51 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  23.16 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  30.81 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  23.22 
 
 
351 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  22.13 
 
 
366 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.77 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  22.36 
 
 
380 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  24.43 
 
 
359 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  26.37 
 
 
383 aa  60.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  27.23 
 
 
375 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.75 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  22.39 
 
 
381 aa  60.1  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  28.26 
 
 
376 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  24 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  23.24 
 
 
387 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  23.75 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  32.08 
 
 
380 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  22.56 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.02 
 
 
387 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.06 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  28.4 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  24.4 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  29.17 
 
 
349 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  27.61 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  24.28 
 
 
356 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  21.75 
 
 
388 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  23.51 
 
 
381 aa  50.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.9 
 
 
349 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.03 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  22.43 
 
 
423 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  22.14 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  25.84 
 
 
368 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  22.76 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  21.17 
 
 
373 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  23.23 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  27.39 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.02 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  27.67 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  27.67 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  23.26 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.51 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  21.92 
 
 
387 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  23.47 
 
 
437 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>