141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2689 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
360 aa  703    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  55.95 
 
 
371 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  54.85 
 
 
360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  39 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  39 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 
386 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  35.99 
 
 
359 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  36.8 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  37.46 
 
 
349 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  36.39 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  37.71 
 
 
360 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  38.16 
 
 
396 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  40.97 
 
 
372 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  36.92 
 
 
366 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  35.58 
 
 
368 aa  178  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  37.99 
 
 
360 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  35.61 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  38.8 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  34.04 
 
 
378 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  35.07 
 
 
352 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  38.76 
 
 
380 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  35.16 
 
 
378 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  33.73 
 
 
351 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  35.17 
 
 
379 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  35.98 
 
 
379 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  35.65 
 
 
393 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  39.88 
 
 
393 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  36.41 
 
 
380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  35.26 
 
 
376 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  51.53 
 
 
171 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  36.57 
 
 
393 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  36.73 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  30.75 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  35.21 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  35.06 
 
 
376 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  35.48 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  35.91 
 
 
359 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  35.45 
 
 
375 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  31.71 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  38.02 
 
 
359 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  37.68 
 
 
359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  33.69 
 
 
381 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  35.16 
 
 
376 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  33.7 
 
 
356 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  35.5 
 
 
383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  30.29 
 
 
388 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  35.24 
 
 
380 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  34.37 
 
 
384 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.66 
 
 
387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  34.49 
 
 
381 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  33.33 
 
 
372 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  33.13 
 
 
355 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  32.16 
 
 
388 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  35.05 
 
 
380 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  26.15 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  30.45 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  33.06 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.23 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.6 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  31.42 
 
 
381 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  29.14 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  25.58 
 
 
376 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  29.52 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  51.49 
 
 
133 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.26 
 
 
383 aa  113  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.45 
 
 
387 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  28.76 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  31.12 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  30 
 
 
387 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  31.65 
 
 
370 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  31.1 
 
 
373 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  33.87 
 
 
382 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  29.86 
 
 
380 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  29.44 
 
 
392 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  28.42 
 
 
374 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  29.49 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  30.17 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  26.24 
 
 
371 aa  96.3  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  26.65 
 
 
419 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  31.81 
 
 
392 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  26.52 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  32.95 
 
 
393 aa  87  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  29.67 
 
 
400 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  27.82 
 
 
394 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  32.86 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  24.21 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  24.53 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  26.69 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  29.56 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  37.93 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  35.54 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  24.66 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  24.36 
 
 
414 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 
418 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  31.84 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  42.31 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  33.53 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  32.05 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>