120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5969 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  764    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  76.59 
 
 		 393 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  77.48 
 
 		 393 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  64.08 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  57.1 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  61.46 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  55.59 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  57.89 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  57.57 
 
 		 364 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  53.46 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  53.99 
 
 		 376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  53.87 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  54.09 
 
 		 375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  53.03 
 
 		 376 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  50.13 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  52.65 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  48.8 
 
 		 378 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  49.73 
 
 		 380 aa  345  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  52.86 
 
 		 359 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  50.25 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  50.53 
 
 		 376 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  49.2 
 
 		 380 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  44.92 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  50.84 
 
 		 355 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  35.71 
 
 		 396 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  34.45 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  39.88 
 
 		 360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  34.05 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  32.78 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  34.52 
 
 		 386 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  36.75 
 
 		 371 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  29.4 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  35.14 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  32.97 
 
 		 354 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  31.84 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  32.13 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  32.13 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  30.89 
 
 		 349 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  27.92 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  29.17 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  27.25 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  28.41 
 
 		 359 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  29.6 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  32.56 
 
 		 360 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  29.48 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  29.21 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  32.28 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  29.32 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  33.42 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  27.1 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  27.42 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30.73 
 
 		 381 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  24.8 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  27.23 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.01 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.37 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  27.35 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.44 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.7 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.63 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.37 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  27.62 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  31.51 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  30.33 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  32.43 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  28.95 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.25 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.62 
 
 		 371 aa  93.2  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  32.43 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  24.14 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  30.68 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  28.38 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  23.4 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  32.4 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  31.18 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  24.54 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  27.47 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  22.85 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  28.03 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  31.84 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  23.51 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  25.41 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  28.38 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  24.61 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  24.62 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  31.06 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  24.68 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  27.98 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  35.4 
 
 		 171 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  28.64 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  27.98 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  28.65 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  28.65 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  26.15 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.48 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  29.82 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  26.61 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  31.03 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.44 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>