89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1609 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 388 aa  802    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  52.82 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  53.23 
 
 		 380 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  49.86 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  51.6 
 
 		 383 aa  359  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  48.01 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  48.79 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  47.31 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  47.04 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  46.28 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  45.72 
 
 		 378 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 393 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  46.93 
 
 		 376 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  45.99 
 
 		 378 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 384 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  44.5 
 
 		 379 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  45.58 
 
 		 375 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  46.92 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  44.15 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  43.73 
 
 		 380 aa  322  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  47.34 
 
 		 359 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  44.21 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  44.92 
 
 		 393 aa  311  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  44.38 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  28.19 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  30.08 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  30.29 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  29.32 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  29.09 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  29.66 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  29.49 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  26.79 
 
 		 424 aa  113  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  27.38 
 
 		 386 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  26.13 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  28.33 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  27.61 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  24.66 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  27.4 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  27.95 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  26.85 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  26.33 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  26.33 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  26.17 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.64 
 
 		 382 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  24.73 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.18 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  25.27 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  25.98 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  26.2 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  25.14 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  23.82 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  23.37 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  24.12 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  26.67 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  26.85 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.76 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  24.6 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  23.34 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  25.88 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  23.55 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.59 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  22.69 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22.97 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.48 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  22.69 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  22.67 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.44 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  23.28 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  24.26 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  22.34 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  24.24 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  22.22 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  23.46 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  21.95 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  25.44 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  22.07 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  24.02 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  23.7 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  30.82 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  31.98 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  21.12 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  23.18 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  21.96 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  25.53 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  23.97 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  23.26 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  26.13 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  25.14 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>