52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11442 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  339  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  51.53 
 
 		 360 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  46.3 
 
 		 360 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  42.33 
 
 		 371 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  35.12 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  31.52 
 
 		 354 aa  68.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  34.78 
 
 		 379 aa  67.4  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  36.88 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  38.99 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  44.23 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  33.93 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  32 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  32 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  34.71 
 
 		 380 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  35 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  35.51 
 
 		 349 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  31.58 
 
 		 349 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  45.16 
 
 		 383 aa  57.8  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  34.68 
 
 		 376 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  33.53 
 
 		 355 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  42.45 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  33.53 
 
 		 359 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  30.82 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  33.95 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  27.98 
 
 		 352 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  33.53 
 
 		 376 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  40.86 
 
 		 376 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  32.37 
 
 		 379 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  34.68 
 
 		 372 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  30.43 
 
 		 371 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  32.1 
 
 		 376 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  29.22 
 
 		 356 aa  48.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  33.56 
 
 		 380 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  34.26 
 
 		 351 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  30.46 
 
 		 360 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  29.14 
 
 		 360 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  26.58 
 
 		 359 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  30 
 
 		 393 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_664  alanine racemase domain protein  29.59 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0827888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  29.59 
 
 		 388 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  31.93 
 
 		 368 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  34.16 
 
 		 393 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  31.68 
 
 		 382 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  27.81 
 
 		 366 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  35.4 
 
 		 393 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0685  alanine racemase domain-containing protein  28.57 
 
 		 220 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.268017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.21 
 
 		 371 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  27.15 
 
 		 366 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  29.2 
 
 		 376 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0758  hypothetical protein  29.59 
 
 		 220 aa  40.8  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  31.25 
 
 		 381 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>