192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6044 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  700    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  89.69 
 
 		 359 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  62.61 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  64.87 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  63.74 
 
 		 360 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  51.45 
 
 		 349 aa  318  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  51.02 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  49.71 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  48.28 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  48.7 
 
 		 352 aa  302  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  47.56 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  46.96 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  46.51 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  46.96 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  46.09 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  49.57 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  37.57 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  41.46 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  40.98 
 
 		 371 aa  189  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  34.57 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  39.44 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  33.51 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  33.06 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  39.28 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  36.69 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  32.59 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  33.61 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  32.04 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.56 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.03 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  35.23 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.97 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  33.42 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  32.36 
 
 		 388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  31.51 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  33.42 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  31.38 
 
 		 387 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  33.76 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  30.79 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.25 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  30.52 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  34.79 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  34.35 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  32.28 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  33.99 
 
 		 380 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  30.27 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  34.81 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  31.23 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  31.9 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  31.43 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  30.75 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  31.1 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  29.19 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  32.96 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  31.48 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  30.19 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  32.7 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  28.49 
 
 		 378 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  32.6 
 
 		 372 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  29.3 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  30.59 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  32.85 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  31.83 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  30 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  30.4 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  30.94 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  27.93 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  29.56 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  29.57 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  29.95 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  31.96 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  31.96 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  28.89 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  26.45 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  29.46 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.85 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  24.18 
 
 		 376 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  28.88 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  33.8 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  31.98 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  33.24 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  29.75 
 
 		 417 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  28.57 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  26.33 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  27.05 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  25.33 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  27.22 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  28.31 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  26.45 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  39.1 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  29.16 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  30.11 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  28.65 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  28.65 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  23.66 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  29.9 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>