170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3891 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  723    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  80.68 
 
 		 355 aa  597  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  80.68 
 
 		 355 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  54.29 
 
 		 349 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  50.87 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  51.71 
 
 		 349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  51.01 
 
 		 352 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  53.98 
 
 		 356 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  48.75 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  50.43 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  49.29 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  49 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  50.83 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  49.44 
 
 		 360 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  46.09 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  46.09 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  42.78 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  35.48 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  35.6 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  35.38 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  34.66 
 
 		 396 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.42 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  32.23 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  34.97 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.97 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  36.46 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  36.71 
 
 		 371 aa  169  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  31.96 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  34.41 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.88 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  34.16 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  32.99 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.42 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  31.15 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  32.42 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  32.51 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  33.7 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  30.68 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  32.97 
 
 		 381 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  29.27 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  32.35 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  31.62 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  30.89 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  31.17 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  34.24 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  29.65 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  31.08 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  34.17 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  32.88 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  33.89 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  31.64 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  31.14 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  29.81 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  30.47 
 
 		 396 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  29.74 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  31.75 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  29.03 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  28.22 
 
 		 375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  29.95 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  30.75 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  31.58 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  30.67 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  30.62 
 
 		 382 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  29.63 
 
 		 379 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  29.23 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  31.79 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  31.11 
 
 		 364 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  30.99 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  29.3 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  29 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  28.01 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  29.38 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  29.01 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  28.37 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  25.34 
 
 		 370 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  26.43 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  27.58 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  28.42 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  27.37 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  30.1 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  29.12 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  26.85 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  29.5 
 
 		 393 aa  95.9  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  28.41 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  28.57 
 
 		 413 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  24.55 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  41.41 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  27.22 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  27.22 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  27.22 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  28.34 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  26.95 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  27.61 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  27.05 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  25.13 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  25.34 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>