89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2565 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 364 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  57.41 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  49.86 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  57.03 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  55.53 
 
 		 383 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  53.66 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  52.3 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  57.3 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  52.7 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  52.03 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  50.67 
 
 		 376 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  51.92 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  50.66 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  53.37 
 
 		 393 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  49.6 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  52.01 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  50.14 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  50.4 
 
 		 375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  48.78 
 
 		 378 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  48.51 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  51.2 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  51.1 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  48.39 
 
 		 379 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  49.01 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  37.94 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  36 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  36.73 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  32.22 
 
 		 396 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  28.88 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  31.11 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  27.97 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  29.8 
 
 		 419 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  29.13 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  27.91 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  29.4 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  29.4 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  31.34 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  26.58 
 
 		 424 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  28.9 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  28.9 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  25.3 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  27.2 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  30.71 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  26.8 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  30.81 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  27.08 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.84 
 
 		 387 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  24.39 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  28.57 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  28.92 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  25 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  31.09 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  30.73 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.91 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  26.96 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.91 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  30.25 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  27.27 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.68 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.99 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.08 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  25.93 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  31.75 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  28.11 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  23.45 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  27.93 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.15 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  26.98 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.26 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  27.32 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  24.59 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  26.27 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  30 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.89 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  38.99 
 
 		 171 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  29.02 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  28.18 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  26.45 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.07 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  26.17 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.59 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  29.43 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  27.11 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  25.6 
 
 		 396 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  28.81 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  30.82 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  23.89 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>