76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2770 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  100 
 
 
394 aa  811    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  32.89 
 
 
375 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  32.99 
 
 
370 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  30.75 
 
 
368 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  29 
 
 
371 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  31.77 
 
 
371 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  31.17 
 
 
374 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  27.84 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  28.38 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.34 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  26.9 
 
 
359 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  24.53 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  29.4 
 
 
372 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  28.69 
 
 
360 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.08 
 
 
383 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  26.77 
 
 
371 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.98 
 
 
362 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  26.43 
 
 
354 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.54 
 
 
384 aa  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.13 
 
 
387 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  26.52 
 
 
382 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  27.82 
 
 
360 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  27.97 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.69 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.65 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  27.2 
 
 
366 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  27.25 
 
 
372 aa  96.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  26.56 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  26.08 
 
 
366 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  27.76 
 
 
366 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  28.88 
 
 
352 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  26.29 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.84 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  24.8 
 
 
355 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  24.8 
 
 
355 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  26.61 
 
 
351 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.48 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  24.73 
 
 
368 aa  90.5  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  27.08 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.09 
 
 
349 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  27.18 
 
 
387 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  26.61 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  27.82 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  28.06 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  27.66 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  27.78 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  28.01 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  28.8 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  26.9 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  28.01 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  25.53 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  23.81 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  29.35 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  22.13 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  21.84 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  26.43 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  25.51 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  23.01 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  27.91 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  25.86 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  26.47 
 
 
396 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  24.87 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  23.01 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  25.21 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  24.13 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  25.75 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  23.1 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  22.1 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  23.27 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  20.62 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  22.62 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  23.89 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  22.38 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  23.2 
 
 
406 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  22.7 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  23.88 
 
 
393 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>