181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1540 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  65.22 
 
 
382 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  65.5 
 
 
387 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  62.7 
 
 
388 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  62.16 
 
 
383 aa  478  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  61.62 
 
 
384 aa  475  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  61.35 
 
 
387 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  61.62 
 
 
387 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  61.62 
 
 
387 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  62.97 
 
 
392 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  60.81 
 
 
387 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  52.29 
 
 
372 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  51.63 
 
 
371 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  46.36 
 
 
372 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  44.84 
 
 
396 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  45.95 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  45.7 
 
 
382 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  43.83 
 
 
392 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  42.39 
 
 
380 aa  282  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 
393 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  45.22 
 
 
393 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  41.71 
 
 
381 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 
383 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  40.95 
 
 
381 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  34.62 
 
 
362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  37.2 
 
 
383 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  34.85 
 
 
371 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  41 
 
 
381 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  34.33 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  32.8 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  32.98 
 
 
376 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  34.15 
 
 
352 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  33.51 
 
 
349 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  33.87 
 
 
366 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  36.19 
 
 
356 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  32.97 
 
 
359 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  32.1 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  32.51 
 
 
354 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  32.88 
 
 
351 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  32.08 
 
 
355 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  32.08 
 
 
355 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  31.89 
 
 
366 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  31.51 
 
 
372 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  32.15 
 
 
360 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  31.88 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  31.06 
 
 
386 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  27.47 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  29.69 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  33.61 
 
 
359 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  32.7 
 
 
359 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  26.49 
 
 
386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  29.92 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  27.84 
 
 
394 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  28.99 
 
 
370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  31.1 
 
 
360 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  27.91 
 
 
380 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  27.25 
 
 
371 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  27.17 
 
 
371 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  24.93 
 
 
376 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  27.11 
 
 
375 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  26.82 
 
 
376 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  27.11 
 
 
376 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  29.28 
 
 
396 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  25.46 
 
 
376 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  25.07 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  27.35 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  25.69 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  27.76 
 
 
360 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  26.56 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  26.69 
 
 
417 aa  89.4  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  26.02 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  28.61 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  27.55 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  27.33 
 
 
421 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  23.75 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  25.46 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  25.14 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  26.76 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  26.62 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  26.3 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.97 
 
 
426 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  25.97 
 
 
426 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.97 
 
 
426 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  24.33 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  23.14 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  26.62 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  24.86 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  28.03 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  26.38 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  25.46 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  26.62 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3106  alanine racemase domain protein  27.3 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  24.04 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  24.52 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  28.11 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  26.17 
 
 
444 aa  80.1  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  26.35 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  25.08 
 
 
416 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  25.08 
 
 
416 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  26.28 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>