229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0179 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  100 
 
 
372 aa  717    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  41.44 
 
 
349 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  44.17 
 
 
355 aa  245  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  44.17 
 
 
355 aa  245  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  42.51 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  42.78 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 
386 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  42.51 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  37.99 
 
 
368 aa  226  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  40.05 
 
 
396 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  40.16 
 
 
359 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  40.16 
 
 
366 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  40 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  43.01 
 
 
371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  39.35 
 
 
366 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  42.86 
 
 
360 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  43.67 
 
 
360 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  40.05 
 
 
366 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  37.03 
 
 
372 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  43.68 
 
 
360 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  34.04 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  33.24 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  41.24 
 
 
360 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  40.58 
 
 
356 aa  192  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  37.01 
 
 
371 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 
393 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  36.46 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  36.69 
 
 
376 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  38.46 
 
 
393 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  37.39 
 
 
393 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  37 
 
 
383 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  36.83 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  36.61 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  34.83 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  37.1 
 
 
381 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  37.06 
 
 
379 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  35.98 
 
 
381 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  36.34 
 
 
384 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  30.73 
 
 
375 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  36.75 
 
 
372 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
387 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  39.78 
 
 
359 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  29.11 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  31.51 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  37.89 
 
 
380 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  33.24 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  38.21 
 
 
364 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  34.3 
 
 
376 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  35.49 
 
 
378 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  34.83 
 
 
378 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  35.73 
 
 
376 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  41.46 
 
 
359 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  31.38 
 
 
374 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  36.07 
 
 
393 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  34.2 
 
 
396 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  32.7 
 
 
381 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  36.51 
 
 
383 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  35.18 
 
 
375 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  35.39 
 
 
382 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  33.99 
 
 
380 aa  156  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  38.82 
 
 
386 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  32.71 
 
 
388 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.05 
 
 
383 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  30.11 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  28.46 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  27.93 
 
 
376 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  35.88 
 
 
359 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  29.79 
 
 
384 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  37.91 
 
 
355 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  31.73 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  34.12 
 
 
392 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.47 
 
 
387 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  37.9 
 
 
380 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.37 
 
 
387 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  32.28 
 
 
387 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  34.23 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.05 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  35.68 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  35.73 
 
 
382 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  32.88 
 
 
368 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  29.32 
 
 
388 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  32.64 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  31.02 
 
 
371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  35.99 
 
 
393 aa  126  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  35.89 
 
 
393 aa  126  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  29.4 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  29.37 
 
 
419 aa  112  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  26.44 
 
 
424 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  28.8 
 
 
444 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  29.18 
 
 
421 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  29.18 
 
 
421 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  29.18 
 
 
421 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  29.18 
 
 
421 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  28.27 
 
 
426 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  28.27 
 
 
426 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  28.27 
 
 
426 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  29.06 
 
 
437 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  32.64 
 
 
429 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>