152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4234 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  100 
 
 
392 aa  775    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  80.15 
 
 
393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  79.9 
 
 
393 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  65.74 
 
 
400 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  61.62 
 
 
396 aa  471  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  58.36 
 
 
372 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  50.53 
 
 
371 aa  316  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  43.83 
 
 
373 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  44.88 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  42.74 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  43.08 
 
 
387 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  42.93 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  41.07 
 
 
387 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  38.96 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  42.13 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  39.1 
 
 
384 aa  268  8e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  44.62 
 
 
392 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  42.51 
 
 
388 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  47.23 
 
 
382 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  42.58 
 
 
380 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  39.57 
 
 
387 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  40.86 
 
 
381 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  37.66 
 
 
381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 
383 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  36.02 
 
 
383 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  35.32 
 
 
371 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  40.27 
 
 
381 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  31.37 
 
 
376 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  31.1 
 
 
376 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  36.29 
 
 
349 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  35.98 
 
 
349 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  30.42 
 
 
362 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  32.4 
 
 
366 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  31.28 
 
 
366 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  30.26 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  35.43 
 
 
372 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  29.48 
 
 
368 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  35.08 
 
 
356 aa  123  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  31.25 
 
 
352 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  29.57 
 
 
354 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  30.38 
 
 
355 aa  116  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  30.38 
 
 
355 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  31.61 
 
 
386 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  32.49 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  26.57 
 
 
375 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  35.15 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  33.58 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  29.21 
 
 
374 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  32.33 
 
 
380 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  28.77 
 
 
359 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  32.13 
 
 
360 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  33.61 
 
 
359 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  27.97 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  31.51 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  30.38 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  31.58 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  31.13 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  28.14 
 
 
370 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  30.94 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  30.7 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  33.99 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  30.22 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  32.09 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  35.97 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  31.69 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  29.2 
 
 
378 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  29.13 
 
 
376 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  33.74 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.6 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  29.92 
 
 
378 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  29.72 
 
 
396 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  33.87 
 
 
380 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  31.9 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  29.34 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  30.84 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  30.84 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  31.71 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  33.6 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  27.87 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  28.79 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  33.47 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  31.91 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  31.62 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  30.79 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  29.9 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  27.06 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  26.27 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  25.63 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  30.45 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  28.95 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  30.77 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  25.63 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.63 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  30.81 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.63 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  26.51 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  25.15 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.94 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  28.65 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>