162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2444 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  96.01 
 
 
376 aa  756    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  784    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  40.6 
 
 
381 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  40.05 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  38.54 
 
 
383 aa  236  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  35.23 
 
 
383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  35.05 
 
 
381 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  33.86 
 
 
372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  32.88 
 
 
380 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.26 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  33.42 
 
 
387 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  32.8 
 
 
384 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.53 
 
 
383 aa  195  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.53 
 
 
387 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  31.9 
 
 
388 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  32.8 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  31.54 
 
 
382 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.72 
 
 
387 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  32.35 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  30.25 
 
 
372 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  30.56 
 
 
392 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.66 
 
 
371 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  31.52 
 
 
396 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  31.98 
 
 
382 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  31.37 
 
 
392 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  31.46 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  30.16 
 
 
362 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  29.27 
 
 
354 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  27.93 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  29.74 
 
 
393 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  28.61 
 
 
355 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  28.61 
 
 
355 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  27.74 
 
 
396 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  28.23 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  28.95 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  29.54 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  27.05 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  27.89 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  28.65 
 
 
349 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  26.88 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  26.15 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  26.61 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  24.8 
 
 
359 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  27.18 
 
 
360 aa  116  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  27.72 
 
 
366 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  27.01 
 
 
366 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  25.88 
 
 
351 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  25.91 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  26.97 
 
 
376 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  26.77 
 
 
356 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  26.13 
 
 
379 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  26.9 
 
 
366 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  27.32 
 
 
370 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  27.19 
 
 
360 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  25.78 
 
 
376 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  28.03 
 
 
376 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  26.92 
 
 
375 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  27.91 
 
 
371 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  22.14 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  26.89 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  25.87 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  28.25 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  25.09 
 
 
379 aa  96.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  26.86 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  24.87 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  24.14 
 
 
393 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  24.39 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  26.04 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  24.8 
 
 
368 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  23.69 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  27.6 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  25.47 
 
 
355 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  22.89 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  28.4 
 
 
425 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  21.93 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  24.83 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  21.93 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  22.63 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  23.69 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  23.28 
 
 
421 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  23.28 
 
 
421 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  23.28 
 
 
421 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  23.28 
 
 
421 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  22.37 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  26.71 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  24.28 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  23.96 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  22.37 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  23.51 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  22.87 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  21.88 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  23.4 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  23.45 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.7 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  22.77 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  26.32 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  24.93 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  25.7 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.7 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  24.18 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>