243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1415 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
386 aa  773    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  41.3 
 
 
372 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  35.8 
 
 
359 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  36.83 
 
 
349 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  36.54 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  36.26 
 
 
355 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  36.26 
 
 
355 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 
354 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 
360 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  37.57 
 
 
371 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  37.27 
 
 
351 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  35.73 
 
 
352 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  35.59 
 
 
360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  35.47 
 
 
396 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  38.17 
 
 
386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  35.01 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  36.07 
 
 
356 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  33.15 
 
 
371 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  37.57 
 
 
359 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  37.15 
 
 
359 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  30.49 
 
 
362 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  31.3 
 
 
368 aa  166  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  34.83 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  35.96 
 
 
360 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  34.82 
 
 
366 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  33.53 
 
 
379 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  31.55 
 
 
372 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  35.04 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  31.4 
 
 
387 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  33.6 
 
 
374 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  32.56 
 
 
393 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  31.53 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  31.06 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  31.41 
 
 
380 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  31.34 
 
 
376 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.3 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  31.59 
 
 
379 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  33.43 
 
 
393 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.9 
 
 
387 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  34.01 
 
 
380 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  30.03 
 
 
384 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  30.31 
 
 
378 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  31.42 
 
 
387 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  34.52 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.12 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  28.23 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  30.56 
 
 
376 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.69 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  29.97 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  33.14 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  30.97 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  30.43 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  30.68 
 
 
375 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  32.5 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.96 
 
 
376 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.01 
 
 
371 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  33.04 
 
 
382 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  29.06 
 
 
396 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  30 
 
 
383 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  32.31 
 
 
392 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  32.05 
 
 
355 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  29.72 
 
 
376 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  28.85 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  33.96 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  30.32 
 
 
359 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  28.3 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  32.39 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  30.14 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  33.72 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  26.49 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  29.36 
 
 
381 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  29.38 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  25.21 
 
 
371 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  30.06 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  31.74 
 
 
380 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  27.38 
 
 
388 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  29.13 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  30.43 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  30.13 
 
 
392 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  29.41 
 
 
370 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  33.24 
 
 
393 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  31.61 
 
 
371 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  32.44 
 
 
393 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  25.94 
 
 
419 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  29.27 
 
 
382 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  26.55 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  23.59 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  27.99 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  27.73 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  24.12 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  26.27 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  29.08 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  29.08 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  29.08 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  24.68 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  35.12 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  26.52 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  28.12 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  24.89 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  27.06 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>