156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5683 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 366 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  90.44 
 
 		 366 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  72.19 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  54.55 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  54.83 
 
 		 349 aa  361  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  51.71 
 
 		 351 aa  349  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  50.29 
 
 		 352 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  49.29 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  49.29 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  49.29 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  48.3 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  49.71 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  49.15 
 
 		 360 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  47.89 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  49.14 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  49.43 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  40.16 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  36.79 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  36.92 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  34.69 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  35.69 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  33.87 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  33.25 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.64 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  37.1 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  31.69 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  33.15 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  34.83 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  33.51 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  34.32 
 
 		 396 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  32.27 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  32.34 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  32.79 
 
 		 368 aa  159  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  32.29 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  33.71 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  33.33 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  31.61 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.91 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  33.89 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  33.14 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  30.91 
 
 		 384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  32.98 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  33.62 
 
 		 375 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  34.08 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  33.25 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  32.11 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  31.62 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  31.41 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  33.52 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  32.76 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  31.77 
 
 		 392 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  31.9 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  33.53 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  31.46 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  32.12 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  30.81 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  34.12 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  30.34 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  32.13 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  30.67 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30.33 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  31.32 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  30.99 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  31.96 
 
 		 393 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  30.42 
 
 		 393 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  30.55 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  29.41 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  30.37 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  31.28 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  33.51 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  32.29 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  28.3 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.57 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  27.72 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  28.44 
 
 		 374 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  28.69 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  27.91 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  30.59 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  30.75 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  28.18 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  27.4 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  26.39 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  26.03 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  27.32 
 
 		 444 aa  96.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  25.55 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  28.45 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  26.08 
 
 		 394 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  27.53 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  25.34 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  25.81 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  27.27 
 
 		 423 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  26.33 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  26.8 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  27.76 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  23.74 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  26.89 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  27.95 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  36.64 
 
 		 133 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  26.82 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  32.16 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>