131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  100 
 
 		 419 aa  830    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  53.26 
 
 		 417 aa  349  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  47.52 
 
 		 447 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  50.25 
 
 		 405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  47.1 
 
 		 429 aa  298  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  49.25 
 
 		 444 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  47.98 
 
 		 436 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  43.16 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  44.27 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  43.78 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  41.42 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  38.36 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  39.36 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  42.93 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  36.6 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  42.41 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  42.41 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0577  alanine racemase domain protein  40.16 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  42.94 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3106  alanine racemase domain protein  37.92 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  38.68 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  39.7 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  38.73 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  40.41 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0929  D-serine deaminase  37.73 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  38.17 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  38.83 
 
 		 426 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  38.27 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  38.83 
 
 		 426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  37.82 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  37.63 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  39.19 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  38.58 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  39.19 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  39.19 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  39.19 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  36.67 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  36.67 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08300  predicted amino acid aldolase or racemase  41.84 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.711035  normal  0.0558619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  38.07 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  38.42 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  36.55 
 
 		 425 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4770  hypothetical protein  36.45 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  37.53 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  36.48 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.4 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 409 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  33.67 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.31 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2983  D-amino acid deaminase  37.78 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.644238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.22 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.06 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  36.99 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  36.99 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  36.73 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  36.55 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  31.01 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1425  amino acid aldolase or racemase-like protein  33.25 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.776677  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06355  D-serine deaminase  33.6 
 
 		 259 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6379  hypothetical protein  36.13 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.619709  normal  0.462883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  32.58 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  22.44 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.8 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.53 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.6 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  28.43 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.27 
 
 		 387 aa  86.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.57 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  25.57 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  28.01 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  27.95 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.61 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  25.56 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  27.35 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  24.93 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.01 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.68 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  26.21 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  26.9 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  24.93 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  27.86 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.84 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  26.67 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.1 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  26.5 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  25.56 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  28.49 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  24.26 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  29.08 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  24.24 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  27.69 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  27.03 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  28.99 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  29.07 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  28.29 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  26.05 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  26.11 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  30.8 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  26.11 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>