140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0557 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  81.69 
 
 
421 aa  713    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  82.39 
 
 
426 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  91.08 
 
 
426 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  82.39 
 
 
426 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  77 
 
 
425 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  91.78 
 
 
426 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  93.66 
 
 
426 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  91.78 
 
 
426 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  81.69 
 
 
421 aa  713    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  81.69 
 
 
421 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  82.39 
 
 
426 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  82.63 
 
 
426 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  81.69 
 
 
421 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  78.17 
 
 
425 aa  714    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  100 
 
 
426 aa  870    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  91.78 
 
 
426 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  93.43 
 
 
426 aa  818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  76.06 
 
 
425 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  67.14 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  64.8 
 
 
425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  64.8 
 
 
425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  64.8 
 
 
425 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4770  hypothetical protein  65.34 
 
 
423 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  61.15 
 
 
424 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  51.91 
 
 
401 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  51.65 
 
 
411 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  50.38 
 
 
406 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  48.98 
 
 
413 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  48.99 
 
 
404 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  46.23 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  40.34 
 
 
437 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  39.61 
 
 
444 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  42.43 
 
 
427 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1425  amino acid aldolase or racemase-like protein  38.08 
 
 
425 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.776677  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0577  alanine racemase domain protein  41.45 
 
 
417 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  37.87 
 
 
432 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  36.95 
 
 
423 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0929  D-serine deaminase  37.56 
 
 
432 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  41.69 
 
 
369 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  37.83 
 
 
421 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 
418 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  39.29 
 
 
409 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  39.07 
 
 
425 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  40.51 
 
 
429 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  37.76 
 
 
416 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  37.76 
 
 
416 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  37.69 
 
 
416 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06355  D-serine deaminase  44.78 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3106  alanine racemase domain protein  34.94 
 
 
423 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  37.62 
 
 
444 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  37.4 
 
 
419 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08300  predicted amino acid aldolase or racemase  35.43 
 
 
457 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.711035  normal  0.0558619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  37.21 
 
 
379 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  35.42 
 
 
447 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  34.62 
 
 
417 aa  186  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  35.92 
 
 
399 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  36.39 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  36.41 
 
 
436 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2983  D-amino acid deaminase  35.73 
 
 
414 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.644238  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6379  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.619709  normal  0.462883 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06354  D-serine deaminase  52.73 
 
 
148 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  27.52 
 
 
380 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  26.57 
 
 
396 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.8 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  25.8 
 
 
384 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  27.95 
 
 
352 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  27.97 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  26.62 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  26.67 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  24.81 
 
 
376 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  24.28 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.58 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  28.16 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  25.79 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.93 
 
 
387 aa  79.7  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.22 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  27.24 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  30.77 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  25.78 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  20.59 
 
 
362 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  26.09 
 
 
366 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  25.07 
 
 
368 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  23.5 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.12 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  28.34 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  22.65 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  27.87 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  30.5 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  30.5 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  23.87 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  24.39 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  24.39 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  22.95 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.87 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  24.45 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  24.4 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  23.35 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  27.27 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  25.7 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  25.64 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>