137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4060 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  78.87 
 
 		 421 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  79.34 
 
 		 426 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  78.87 
 
 		 426 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  80.99 
 
 		 426 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  100 
 
 		 425 aa  873    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  78.87 
 
 		 426 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  78.87 
 
 		 426 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  78.87 
 
 		 426 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  78.87 
 
 		 421 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  78.87 
 
 		 421 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  79.58 
 
 		 426 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  79.34 
 
 		 426 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  78.87 
 
 		 421 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  77 
 
 		 426 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  79.11 
 
 		 426 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  78.4 
 
 		 426 aa  713    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  87.06 
 
 		 425 aa  782    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  97.18 
 
 		 425 aa  852    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  66.35 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  64.72 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  64.72 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  64.49 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4770  hypothetical protein  64.55 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  60.34 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  48.72 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  48.34 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  49.36 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  47.58 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  49.49 
 
 		 404 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  44.02 
 
 		 406 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  40.95 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  37.5 
 
 		 432 aa  269  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  40.94 
 
 		 437 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  40.2 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0929  D-serine deaminase  37.5 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  37.62 
 
 		 423 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1425  amino acid aldolase or racemase-like protein  38.03 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.776677  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0577  alanine racemase domain protein  40.28 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  42.75 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  39.74 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  37.85 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  40 
 
 		 369 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  38.54 
 
 		 416 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  38.54 
 
 		 416 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  38.48 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3106  alanine racemase domain protein  37.69 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  38.14 
 
 		 409 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  37.4 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06355  D-serine deaminase  43.07 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  38.17 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  37.01 
 
 		 444 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  34.62 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08300  predicted amino acid aldolase or racemase  35.36 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.711035  normal  0.0558619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  36.95 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  37.21 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  37.9 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  36.55 
 
 		 405 aa  186  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  35.43 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2983  D-amino acid deaminase  33.26 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.644238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6379  hypothetical protein  30.5 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.619709  normal  0.462883 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06354  D-serine deaminase  50.91 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  27.92 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  28.8 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  26.23 
 
 		 372 aa  87  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  28.4 
 
 		 376 aa  86.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  23.94 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  26.36 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  27.95 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  24.44 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  24.8 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  22.85 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.4 
 
 		 349 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.66 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.36 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  24.8 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.8 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  25.13 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  24.79 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  28.38 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.66 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  25.34 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  25.34 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  24.44 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  21.63 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  22.77 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  24.73 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  27.97 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  25.51 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  25.07 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  24.6 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.3 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  25.92 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  29.29 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.4 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  26.5 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  25.5 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  23.95 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.62 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  26.27 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  28.33 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>