134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2011 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  756    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  42.47 
 
 
421 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  43.55 
 
 
429 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  42.33 
 
 
425 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  41.6 
 
 
416 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  41.6 
 
 
416 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  41.6 
 
 
416 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  39.36 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08300  predicted amino acid aldolase or racemase  42.11 
 
 
457 aa  219  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.711035  normal  0.0558619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  37.82 
 
 
406 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  37.63 
 
 
411 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  37.8 
 
 
401 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  40.05 
 
 
418 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  37.53 
 
 
419 aa  208  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  38.36 
 
 
432 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  39.28 
 
 
426 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0577  alanine racemase domain protein  40.05 
 
 
417 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  39.28 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  38.69 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  39.02 
 
 
426 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  39.38 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  39.38 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  39.38 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  39.38 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  39.02 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  37.98 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.98 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.98 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0929  D-serine deaminase  35.92 
 
 
432 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560521  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  37.99 
 
 
444 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  37.63 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3106  alanine racemase domain protein  37 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  41.58 
 
 
436 aa  196  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  40.68 
 
 
369 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  36.95 
 
 
426 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  37.21 
 
 
425 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.21 
 
 
426 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  38.16 
 
 
437 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  38.21 
 
 
405 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  37.21 
 
 
426 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  37.31 
 
 
427 aa  192  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  36.69 
 
 
426 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  36.62 
 
 
425 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  37.63 
 
 
422 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  34.45 
 
 
417 aa  189  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  36.6 
 
 
425 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  37.98 
 
 
425 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  36.53 
 
 
425 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  36.53 
 
 
425 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  40.69 
 
 
447 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  37.66 
 
 
424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  31.33 
 
 
413 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4770  hypothetical protein  36.53 
 
 
423 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  35.15 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  32.9 
 
 
404 aa  170  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2983  D-amino acid deaminase  39.08 
 
 
414 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.644238  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1425  amino acid aldolase or racemase-like protein  34.94 
 
 
425 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.776677  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  33.51 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06355  D-serine deaminase  34.12 
 
 
259 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6379  hypothetical protein  32.88 
 
 
436 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.619709  normal  0.462883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  24.74 
 
 
362 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.78 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  30.33 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  28.38 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  27.76 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  29.83 
 
 
372 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  32.79 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  26.38 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.5 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  32.45 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.94 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  26.01 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  28.03 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  27.93 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  32.88 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.58 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  23.43 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  35.71 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  25.68 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  28.42 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  27.5 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  30.03 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  26.64 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  29.65 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  30.72 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  27.51 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  28.62 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  24.69 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  25.98 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  29.56 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.69 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  26.3 
 
 
366 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  28.33 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  31.95 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  26.69 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  27.36 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  26.11 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  26.11 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  25.33 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  25.17 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>