131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0549 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  857    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  66.59 
 
 		 406 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  47.84 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  47.58 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  47.58 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  48.98 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  48.98 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  49.49 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  48.73 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  48.73 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  49.24 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  49.24 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  48.48 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  47.83 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  47.83 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  48.22 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  48.22 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  48.22 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  48.73 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  48.73 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  48.73 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  48.73 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  48.73 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  47.83 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  46.53 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  45.52 
 
 		 411 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  44.78 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  44.03 
 
 		 422 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4770  hypothetical protein  43.84 
 
 		 423 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  44.95 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  36.78 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  39.27 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  36.05 
 
 		 432 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0929  D-serine deaminase  34.49 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1425  amino acid aldolase or racemase-like protein  35.84 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.776677  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06355  D-serine deaminase  47.15 
 
 		 259 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  37.92 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  35.5 
 
 		 437 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  35.41 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3106  alanine racemase domain protein  35.53 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  35.25 
 
 		 421 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  33.17 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  34.18 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  34.18 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  33.92 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  34.75 
 
 		 429 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  33.67 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  34.92 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0577  alanine racemase domain protein  33.5 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  33.07 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  34.1 
 
 		 369 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  32.32 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  34.5 
 
 		 405 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  33.42 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  32.42 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  31.33 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  33.17 
 
 		 436 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2983  D-amino acid deaminase  33.85 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.644238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08300  predicted amino acid aldolase or racemase  31.63 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.711035  normal  0.0558619 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6379  hypothetical protein  29.72 
 
 		 436 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.619709  normal  0.462883 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06354  D-serine deaminase  50.86 
 
 		 148 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  26.56 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.95 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  30.13 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  30.13 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  26.42 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.78 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  28.29 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  26.39 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  27.32 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.07 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  25.59 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  28.57 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  25.53 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  23.27 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  27.99 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.83 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.74 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  28.3 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  26.74 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  28.48 
 
 		 349 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.75 
 
 		 384 aa  87  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.73 
 
 		 387 aa  86.3  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.53 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  25.14 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  27.15 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  25.33 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  23.46 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.58 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  26.11 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  26.05 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  27.73 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  30.83 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  27.34 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  27.47 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  28.03 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  23.1 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  27.47 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  26.76 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  24.55 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>