124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1425 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1425  amino acid aldolase or racemase-like protein  100 
 
 		 425 aa  858    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.776677  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  38.5 
 
 		 425 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  38.73 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  39.57 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  38.24 
 
 		 425 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  38.28 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  39.12 
 
 		 426 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  41.49 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  38.46 
 
 		 437 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  39.1 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  39.57 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  38.89 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  37.68 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  38.86 
 
 		 426 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  36.84 
 
 		 432 aa  256  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  38.32 
 
 		 426 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  38.61 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  38.86 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  38.12 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4770  hypothetical protein  39.09 
 
 		 423 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  37.2 
 
 		 426 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.2 
 
 		 426 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  38.86 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  38.86 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2307  hypothetical protein  38.86 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  38.86 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  37.2 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0929  D-serine deaminase  36.36 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  38.46 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  36.59 
 
 		 413 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  38.66 
 
 		 411 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  40.24 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 418 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3106  alanine racemase domain protein  37.56 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  37.77 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  41.27 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  36.78 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  38.07 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  37.56 
 
 		 422 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  39.67 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  38.95 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  38.95 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  35.81 
 
 		 406 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0093  hypothetical protein  36.36 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  34.56 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0577  alanine racemase domain protein  37.95 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  39.46 
 
 		 369 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08300  predicted amino acid aldolase or racemase  37.18 
 
 		 457 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.711035  normal  0.0558619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  35.83 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  37.12 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  35.41 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  34.72 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  36.65 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  34.94 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  34.34 
 
 		 419 aa  170  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06355  D-serine deaminase  34.72 
 
 		 259 aa  160  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  33.51 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6379  hypothetical protein  32.16 
 
 		 436 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.619709  normal  0.462883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2983  D-amino acid deaminase  33.69 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.644238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  25 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  23.18 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.95 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06354  D-serine deaminase  31.71 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.02 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  24.87 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  29.89 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  26.32 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  27.04 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  25.07 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.97 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  26.03 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  23.81 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  24.27 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  28.72 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.4 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.4 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  25.93 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  27.51 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  26.23 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  29.8 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  23.24 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  24.57 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  23.75 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  26.6 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.56 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  27.08 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  28.18 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  22.51 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.98 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.65 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  22.51 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  25.27 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  23.78 
 
 		 359 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  22.69 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  22.03 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  21.3 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  25.22 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  25.22 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.33 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>