165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4875 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  100 
 
 
371 aa  755    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  38.75 
 
 
349 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  37.13 
 
 
349 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  34.85 
 
 
373 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  33.7 
 
 
382 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  33.96 
 
 
387 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  33.79 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  33.79 
 
 
388 aa  199  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  34.69 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.88 
 
 
387 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  33.24 
 
 
387 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  35.6 
 
 
354 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  36.31 
 
 
371 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  33.15 
 
 
392 aa  189  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  32.8 
 
 
359 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.77 
 
 
383 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  30.77 
 
 
384 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  34.04 
 
 
372 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  32.15 
 
 
387 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  35.79 
 
 
352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  33.42 
 
 
360 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  32.24 
 
 
362 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  35.32 
 
 
392 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  33.16 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  33.16 
 
 
355 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  33.16 
 
 
355 aa  173  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  33.15 
 
 
386 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  33.15 
 
 
366 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  33.51 
 
 
382 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  31.34 
 
 
366 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  31.55 
 
 
381 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  31.51 
 
 
396 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  31.62 
 
 
372 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  35.17 
 
 
393 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  33.33 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  32.34 
 
 
381 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  31.42 
 
 
351 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  28.61 
 
 
383 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  34.21 
 
 
393 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  31.17 
 
 
366 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  30.6 
 
 
380 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  30.19 
 
 
383 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  32.97 
 
 
356 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  31.89 
 
 
386 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  34.16 
 
 
359 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  32.08 
 
 
374 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  33.24 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  28.76 
 
 
368 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  29.53 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  27.05 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  31.54 
 
 
368 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  29.35 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.05 
 
 
376 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  31.89 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  26.63 
 
 
375 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  28.61 
 
 
370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  29.14 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  29.65 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  29.97 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  27.61 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  26.94 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  26.12 
 
 
378 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  29.13 
 
 
379 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  26.77 
 
 
394 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  27.53 
 
 
376 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  27.61 
 
 
388 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  26.82 
 
 
384 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  25.73 
 
 
376 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  26.65 
 
 
393 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  25.46 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  26.39 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  27.5 
 
 
380 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  27 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  25.93 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  27.42 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  27.17 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  26.58 
 
 
380 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  27.17 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  25.14 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  29.86 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  24.59 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  27.23 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  24.04 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  26.98 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  22.65 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  22.93 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  23.69 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  25.19 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  25.07 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  24.1 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  24.1 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  22.65 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  24.06 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  25.98 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  25.14 
 
 
421 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  23.06 
 
 
417 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  25.07 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1425  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.25 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.776677  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  26.34 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  24.49 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>