161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0743 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  100 
 
 
355 aa  726    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  100 
 
 
355 aa  726    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  80.68 
 
 
354 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  55.56 
 
 
349 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  53.56 
 
 
349 aa  355  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  50 
 
 
351 aa  342  8e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  48.31 
 
 
359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  48.99 
 
 
352 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  52.14 
 
 
356 aa  331  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  49.29 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  49.57 
 
 
366 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  49 
 
 
366 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  51.25 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  50.42 
 
 
360 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  47.25 
 
 
359 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  46.96 
 
 
359 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  44.17 
 
 
372 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  38.77 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  36.26 
 
 
386 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  35.81 
 
 
396 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  39 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  36.11 
 
 
371 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  33.85 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  36.96 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  33.16 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 
360 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  34.25 
 
 
372 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  34.79 
 
 
380 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  33.14 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  32.61 
 
 
381 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  33.24 
 
 
381 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  32.14 
 
 
387 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.77 
 
 
387 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  31.32 
 
 
388 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  32.08 
 
 
373 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  32.88 
 
 
382 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.25 
 
 
387 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  34.45 
 
 
380 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  31.77 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  30.3 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  31.9 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.77 
 
 
387 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  32.69 
 
 
392 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  33.88 
 
 
379 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.86 
 
 
383 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  29.86 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  31.08 
 
 
376 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  28.61 
 
 
376 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  31.87 
 
 
376 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.49 
 
 
376 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  31.17 
 
 
378 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  31.61 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  29.38 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  32.71 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  30.18 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  32.58 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  32.31 
 
 
380 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  30.91 
 
 
396 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  32.56 
 
 
355 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  29.06 
 
 
383 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  31.12 
 
 
380 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  30.79 
 
 
393 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  30.89 
 
 
400 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  30.7 
 
 
375 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  28.18 
 
 
384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  28.85 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  29.26 
 
 
376 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  30.29 
 
 
393 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  29.81 
 
 
393 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  31.65 
 
 
383 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  29.53 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  29.94 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  30.38 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  28.49 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  29.4 
 
 
364 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  29.51 
 
 
359 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  27.46 
 
 
371 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  27.44 
 
 
370 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  30.13 
 
 
413 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  28.84 
 
 
393 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  30.06 
 
 
393 aa  99.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  27.53 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  30.25 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  28.21 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  26.33 
 
 
388 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  24.8 
 
 
394 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  29.48 
 
 
393 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  26.54 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  43.75 
 
 
133 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  29.65 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  27.54 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  23.31 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  26.72 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  26 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  26.86 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  26.33 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  27.03 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  25.34 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  26.06 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  25.08 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>