145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04740 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  100 
 
 		 371 aa  731    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  55.95 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  55.41 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  42.74 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  38.02 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  38.02 
 
 		 360 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  37.74 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  37.57 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  38.24 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  37.26 
 
 		 349 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  37.91 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  36.24 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  36.96 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  36.96 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  35.69 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  36.19 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  36.71 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  32.1 
 
 		 368 aa  166  9e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  36.16 
 
 		 380 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  35.12 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  39.07 
 
 		 380 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  37.82 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  35.09 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  40.98 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  33.98 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  34.56 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  58.33 
 
 		 133 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  33.8 
 
 		 378 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  37.54 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  34.56 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  35.85 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  37.19 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  35.62 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  36 
 
 		 364 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  36.31 
 
 		 379 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  35.26 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  35.29 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  36.22 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  34.73 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  34.31 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  34.86 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  32.2 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  28.8 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  34.85 
 
 		 382 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  36.22 
 
 		 393 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  35.63 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  35.41 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  30.19 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  34.92 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  36.2 
 
 		 383 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  32.98 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  31.64 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  33.33 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  29.66 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  29.92 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  30.93 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  32.71 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  29.97 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  32.54 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  42.33 
 
 		 171 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  31.22 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  25.91 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  29.74 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  25.13 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  29.63 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.24 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  29.55 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  28.57 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  27.86 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.81 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  30.34 
 
 		 392 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  30.28 
 
 		 392 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  27.34 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  27.06 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  31.69 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  28.36 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.53 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  25.86 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  26.1 
 
 		 424 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  28.07 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  27.01 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  28.53 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  30.22 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  28.01 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  24.73 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  28.77 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  25.45 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  25.47 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  29.53 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  36.59 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  33.33 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0929  D-serine deaminase  32.5 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560521  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  28.99 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  33.95 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5480  alanine racemase domain protein  33.78 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  30.17 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  31.01 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  36.81 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>