59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11443 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  264  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  58.33 
 
 		 371 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  56.49 
 
 		 360 aa  143  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  51.49 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  40.77 
 
 		 349 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  35.88 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  36.64 
 
 		 366 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  45.22 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  43.75 
 
 		 355 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  43.75 
 
 		 355 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 354 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  40.46 
 
 		 360 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  36.64 
 
 		 359 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  39.84 
 
 		 360 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  38.81 
 
 		 372 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  40 
 
 		 366 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  37.19 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  32.76 
 
 		 362 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  37.93 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  43.22 
 
 		 386 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  32.31 
 
 		 396 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  34.85 
 
 		 371 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  36.22 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  39.1 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  39.85 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  35.11 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  36.11 
 
 		 368 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  34.75 
 
 		 393 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  30.47 
 
 		 386 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  30.97 
 
 		 368 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  28.93 
 
 		 380 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  34.55 
 
 		 359 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 		 375 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  31.82 
 
 		 376 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  29.75 
 
 		 380 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  31.09 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  34.68 
 
 		 381 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  30.71 
 
 		 381 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  29.23 
 
 		 376 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  25.45 
 
 		 375 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  33.05 
 
 		 383 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  31.91 
 
 		 380 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  25.38 
 
 		 378 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.14 
 
 		 371 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  26.36 
 
 		 376 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  34.96 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  30.77 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  30.99 
 
 		 394 aa  42  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  26.36 
 
 		 378 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  28.28 
 
 		 382 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  29.57 
 
 		 372 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  31.36 
 
 		 382 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  29.46 
 
 		 424 aa  41.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  28.83 
 
 		 380 aa  40.8  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  23.64 
 
 		 370 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.43 
 
 		 387 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  27.68 
 
 		 388 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  33.03 
 
 		 393 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>