151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0490 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  96.69 
 
 
393 aa  684    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
393 aa  780    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  79.9 
 
 
392 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  66.15 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  60.76 
 
 
396 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  58.09 
 
 
372 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  51.46 
 
 
371 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  45.22 
 
 
373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  45.85 
 
 
387 aa  298  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  45.43 
 
 
382 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  44.92 
 
 
387 aa  283  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  44.12 
 
 
388 aa  282  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  41.24 
 
 
383 aa  280  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  43.95 
 
 
387 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  45 
 
 
392 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  42.82 
 
 
387 aa  278  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  40.72 
 
 
384 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 
372 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  46.26 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  48.02 
 
 
382 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  42.78 
 
 
387 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  41.4 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  40.86 
 
 
383 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  39.1 
 
 
383 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  39.38 
 
 
381 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  43.18 
 
 
381 aa  193  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  35.17 
 
 
371 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  34.74 
 
 
349 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  31.03 
 
 
376 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  35 
 
 
349 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  30.26 
 
 
376 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  30.89 
 
 
362 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  32.81 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  32.29 
 
 
366 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  36.16 
 
 
372 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  36.99 
 
 
356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  33.52 
 
 
352 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  30.92 
 
 
351 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  28.8 
 
 
366 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  35.08 
 
 
380 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  33.51 
 
 
386 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  32.16 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  30.9 
 
 
374 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  29.71 
 
 
354 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  29.97 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  32.95 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  32.35 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  32.27 
 
 
360 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  29.19 
 
 
355 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  29.19 
 
 
355 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  34.27 
 
 
359 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  30.51 
 
 
368 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  34.84 
 
 
360 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  33.52 
 
 
384 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  31.23 
 
 
360 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  30.13 
 
 
394 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  27.07 
 
 
375 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  32.68 
 
 
371 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  28.26 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  30.85 
 
 
382 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  24.93 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  34.17 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  31.18 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  28.88 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  28.88 
 
 
378 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  28.42 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  29.03 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  30.51 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  30.89 
 
 
375 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  29.43 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  30.46 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  31.17 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  29.22 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  28.09 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  31 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  26.76 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  29.87 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  29.61 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  29.61 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  29.01 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  30.3 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  26.61 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  26.46 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  27.98 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  28.38 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  28.42 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  30.42 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  26.54 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  28.25 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  24.25 
 
 
425 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  27.87 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  25.48 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  28.88 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2792  amino acid aldolase or racemase-like protein  25.23 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  24.77 
 
 
426 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2742  amino acid aldolase or racemase-like protein  24.77 
 
 
426 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  24.77 
 
 
426 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  25.29 
 
 
426 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  23.51 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  32.01 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>