147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4878 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  100 
 
 
386 aa  743    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  39.16 
 
 
349 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  39.16 
 
 
349 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  37.05 
 
 
366 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  35.25 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  35.25 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  36.79 
 
 
366 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  39.25 
 
 
386 aa  195  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  33.94 
 
 
354 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  37.63 
 
 
366 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  36.26 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  39.06 
 
 
360 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  34.65 
 
 
359 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  38.92 
 
 
356 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  34.95 
 
 
380 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  32.49 
 
 
372 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  33.68 
 
 
352 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  32.32 
 
 
371 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  37.19 
 
 
371 aa  162  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  38.72 
 
 
372 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  36.98 
 
 
360 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  31.58 
 
 
388 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 
359 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  30.25 
 
 
387 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.58 
 
 
387 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  31.14 
 
 
373 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.83 
 
 
387 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  33.33 
 
 
360 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.89 
 
 
387 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  32.28 
 
 
360 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  34.94 
 
 
372 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  30.15 
 
 
387 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  27.27 
 
 
362 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  28.86 
 
 
384 aa  149  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.86 
 
 
383 aa  149  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  28.68 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  32.75 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  32.74 
 
 
371 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  32.75 
 
 
383 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  32.4 
 
 
382 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  40.27 
 
 
359 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  32.51 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  29.75 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  30.2 
 
 
392 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  28.24 
 
 
368 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  31.37 
 
 
400 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  30.15 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  33.06 
 
 
379 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  28.71 
 
 
396 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  34.02 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  32.77 
 
 
392 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  34.04 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  33.87 
 
 
380 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.99 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  30.73 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  26.56 
 
 
375 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  23.43 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  32.11 
 
 
393 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  30.55 
 
 
375 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  31.86 
 
 
393 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  29.61 
 
 
376 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  30.19 
 
 
379 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  31.28 
 
 
376 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  33.25 
 
 
393 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  30.33 
 
 
376 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  32.45 
 
 
393 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  29.47 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  29.95 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  32.63 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.24 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  30.77 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  26.83 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  27.91 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  31.98 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  25.19 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  29.7 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  30.58 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  27.74 
 
 
388 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  29.9 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  26.41 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  26.17 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  29.03 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  27.81 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  30.21 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  31.11 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  27.4 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  26.34 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  27.76 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  26.99 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0666  alanine racemase domain protein  29.16 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  27.7 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  28.57 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  44.07 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  24.35 
 
 
425 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  24.2 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  26.05 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  29.59 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  28.42 
 
 
447 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0364  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  24.09 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>