105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0404 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  100 
 
 
380 aa  758    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  39.07 
 
 
371 aa  169  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  37.2 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  38.76 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  35.63 
 
 
356 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  34.45 
 
 
355 aa  159  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  34.45 
 
 
355 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  33.89 
 
 
354 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  37.91 
 
 
360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  37.9 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  31.4 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  32.85 
 
 
352 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  31.04 
 
 
378 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  32.58 
 
 
366 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  32.75 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  33.15 
 
 
379 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  33.05 
 
 
355 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  31.28 
 
 
366 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  31.04 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  31.46 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  31.08 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  30.89 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  32.1 
 
 
359 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  31.87 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  31.81 
 
 
375 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  31.56 
 
 
349 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
381 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  31.27 
 
 
376 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  29.59 
 
 
376 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  30.05 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  31.74 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  30.87 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  31.23 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  32.8 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  32.68 
 
 
360 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  30.16 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.9 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  27.08 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  26.46 
 
 
362 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  32.8 
 
 
393 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  28.93 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  28.57 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  30.08 
 
 
360 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  30.96 
 
 
383 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  33.61 
 
 
359 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  33.77 
 
 
386 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  31.35 
 
 
393 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.31 
 
 
371 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  31.62 
 
 
380 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  33.8 
 
 
359 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  30.6 
 
 
381 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  28.69 
 
 
372 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  28.8 
 
 
380 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  29.82 
 
 
381 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  30.35 
 
 
374 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  30.45 
 
 
380 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.31 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.88 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.01 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.12 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  28.96 
 
 
383 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  30.25 
 
 
364 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  26.27 
 
 
371 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  22.87 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.47 
 
 
384 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  26.68 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.97 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  28.03 
 
 
373 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  26.29 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  28.23 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  23.82 
 
 
388 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  27.13 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.25 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  26.02 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  25.14 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  22.65 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  26.19 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  26.96 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  25.27 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  29.46 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  27.56 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  29.41 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  27.5 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  27.07 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  23.8 
 
 
424 aa  63.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  26.68 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  25.21 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  25.61 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  23.19 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  26.49 
 
 
419 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11443  hypothetical protein  36.22 
 
 
133 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.483884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  25.83 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  33.95 
 
 
171 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  28.8 
 
 
447 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  25 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  30.05 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  30.05 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  30.05 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  37.93 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0887235 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>