133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5822 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  92.39 
 
 		 379 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 355 aa  729    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  70.14 
 
 		 359 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  70.99 
 
 		 376 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  67.7 
 
 		 376 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  68.73 
 
 		 376 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  68.17 
 
 		 376 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  68.91 
 
 		 375 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  69.47 
 
 		 380 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  68.17 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  64.33 
 
 		 378 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  63.38 
 
 		 378 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  57.26 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  55.06 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  51.12 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  53.14 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  49.01 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  50.98 
 
 		 393 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  49.01 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  49.01 
 
 		 380 aa  309  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  49.72 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  44.38 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  50.84 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  49.02 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  35.15 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  34.02 
 
 		 366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  33.53 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  33.53 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  37.91 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  35.41 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  27.99 
 
 		 424 aa  132  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  33.53 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  29.22 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  32.05 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  32.56 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  32.56 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  31.79 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  33.13 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  33.05 
 
 		 380 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  28.95 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  29.02 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  28.78 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  29.26 
 
 		 419 aa  119  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  29.66 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  30.25 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  29.46 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  30.09 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  30.09 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  28.4 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  30.7 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  29.5 
 
 		 381 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.23 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  29.12 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  32.82 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  25.47 
 
 		 376 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  28.96 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  29.79 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.93 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.27 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.61 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  25.5 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.71 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  23.99 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  24.28 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  29.34 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  23.7 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  25.95 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  26.86 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  27.18 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  23.41 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  23.28 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.93 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.8 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  26.24 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  24.63 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  29.52 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  27.65 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  25.07 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  22.86 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  23.71 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  25.3 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  23.32 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  27.65 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  25.91 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  25.98 
 
 		 444 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  28.14 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  31.29 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  26.97 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  33.53 
 
 		 171 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  30.83 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  26.45 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  33.9 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  31.58 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  26.63 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  25.94 
 
 		 400 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  30.71 
 
 		 411 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  28.66 
 
 		 426 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  26.74 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2659  amino acid aldolase or racemase-like protein  30 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>