145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1233 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 371 aa  761    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  53.39 
 
 		 375 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  51.9 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 		 370 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  41.98 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  38.27 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  31.77 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  31.02 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  28.01 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  27.61 
 
 		 371 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  26.16 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  29.09 
 
 		 396 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.76 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  27.17 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  31.61 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  28.22 
 
 		 352 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  28.22 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.93 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  28.08 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  26.29 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  29.01 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  28.92 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  29.97 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  27.46 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  27.46 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  31.51 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  27.91 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.52 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  28.96 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  27.55 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  28.19 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  28.57 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.68 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  26.95 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  24.73 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.68 
 
 		 384 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  25.88 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  24.66 
 
 		 382 aa  93.6  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.8 
 
 		 387 aa  92.8  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  29.48 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  30.47 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  26.18 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.53 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  25.81 
 
 		 380 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  25.56 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  28.45 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  24.33 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  26.76 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  25.27 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  27.39 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  29.17 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  29.36 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  26.53 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  25.07 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  29.75 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  27.86 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  25.22 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  29.43 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0845  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  25.54 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  26.54 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  25.2 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  25.19 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  23.8 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  26.25 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  26.67 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  25.73 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  25.8 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  26.95 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  23.06 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  24.24 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  26.75 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  22.89 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  24.73 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  24.33 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  24.26 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  24.72 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  25.21 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  23.32 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  22.99 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  25.27 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  24.86 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  22.69 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  26.92 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  23.14 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  26.42 
 
 		 364 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  23.26 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  23.26 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  25.2 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  22.75 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  25.82 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  22.7 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  23.25 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  23 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  23.94 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  23.32 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  25.21 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0176  D-serine deaminase, putative  23.83 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  27.91 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2772  hypothetical protein  23.83 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2387  hypothetical protein  23.83 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>