98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1147 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 382 aa  775    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  61.89 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  61.84 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  57.56 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  60.42 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  61.19 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  59.73 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  55.91 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  54.47 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  55.23 
 
 		 376 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  52.09 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  53.89 
 
 		 380 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  53.44 
 
 		 375 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  52.97 
 
 		 380 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  54.01 
 
 		 376 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  52.38 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  49.73 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  52.27 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  51.32 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  51.19 
 
 		 378 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  52.62 
 
 		 359 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  50 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  50.27 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  49.02 
 
 		 355 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  35.22 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  35.56 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  35.34 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  35.87 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  31.84 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  33.04 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  31.08 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  33.24 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  32.16 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  30.16 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  28.92 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  32.8 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  31.27 
 
 		 355 aa  121  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  31.27 
 
 		 355 aa  121  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  30.79 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  29.57 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  27.63 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  28.95 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.16 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  26.91 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.97 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  28.26 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  27.49 
 
 		 424 aa  109  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  28.34 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  30.35 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  30.14 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  26.78 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  29.18 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  26.51 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.08 
 
 		 387 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  29.65 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  27.69 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  31.76 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.53 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.56 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.56 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  30.94 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  29.1 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  25.94 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  30.72 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  25.53 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  28.34 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  27.17 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  28.49 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  24.33 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  30.58 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  22.5 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  26.5 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  27.96 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  27.69 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  30.66 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  29.12 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  21.94 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  25.68 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  28.19 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  29.24 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  24.72 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  24.86 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  26.3 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  26.61 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.75 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  25.27 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11442  hypothetical protein  36.65 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  24.94 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  24.68 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  23.91 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0092  alanine racemase domain protein  24.28 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3329  D-serine deaminase  26.52 
 
 		 444 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  32.03 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  25.94 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.42 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  21.47 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  24.48 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>