More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1676 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  55.27 
 
 		 808 aa  897    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 875 aa  1801    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  46.53 
 
 		 792 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  44.8 
 
 		 795 aa  700    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 904 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  30.55 
 
 		 846 aa  352  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 883 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 886 aa  294  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 753 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 742 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 786 aa  231  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 757 aa  230  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  25.11 
 
 		 784 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  26 
 
 		 822 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 777 aa  201  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 762 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 734 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 747 aa  197  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 785 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 806 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 807 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 791 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 802 aa  181  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 		 856 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 780 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 780 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  24.82 
 
 		 889 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 797 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 771 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 808 aa  167  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 763 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 781 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 798 aa  159  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 766 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 788 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 775 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 809 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 757 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 795 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 795 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 780 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 807 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 777 aa  144  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 752 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 769 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  22.85 
 
 		 830 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 779 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 789 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 730 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 730 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 724 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 732 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  40.87 
 
 		 731 aa  130  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 743 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 775 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 749 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 777 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 792 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 722 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 746 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 783 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  24.68 
 
 		 801 aa  125  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 365 aa  125  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 790 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 712 aa  124  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 803 aa  124  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 896 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 735 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 703 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 809 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 794 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  37.43 
 
 		 753 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 737 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 702 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 764 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 971 aa  118  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 844 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 773 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 747 aa  118  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 758 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 847 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 764 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 729 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 784 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 862 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 744 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 829 aa  110  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 763 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  22.76 
 
 		 776 aa  109  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  24.09 
 
 		 691 aa  108  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 969 aa  108  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 832 aa  108  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 825 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 783 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>