More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 684 aa  1403    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  43.21 
 
 		 688 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  39.94 
 
 		 741 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 649 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 713 aa  254  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 713 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 733 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 751 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54950  hypothetical protein  30.62 
 
 		 448 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000722946  unclonable  3.2012599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 724 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 710 aa  181  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 732 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 730 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.64 
 
 		 739 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 720 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 741 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 695 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 769 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 704 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 853 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 731 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.69 
 
 		 755 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 851 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 780 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 743 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 761 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.71 
 
 		 715 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 734 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 767 aa  162  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 722 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 794 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 771 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 786 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 773 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 824 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 780 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 726 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 726 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 776 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 723 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 755 aa  153  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 702 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 780 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 767 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 725 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 763 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 800 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 800 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 790 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 717 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 766 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 788 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 690 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 753 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 790 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 730 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 748 aa  147  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 690 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 764 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 757 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 730 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 741 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 745 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 773 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 795 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 736 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 778 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 695 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 778 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 744 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 762 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 785 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 753 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 759 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 703 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 734 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 680 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 779 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 757 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 694 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 769 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 765 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 809 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 722 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  26.6 
 
 		 822 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 732 aa  137  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.5 
 
 		 685 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 720 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 738 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 764 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 809 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 774 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 749 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 775 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 759 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54960  hypothetical protein  39.57 
 
 		 322 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000341506  unclonable  2.05856e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>