More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1474 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 817 aa  1660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  37.86 
 
 		 803 aa  429  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 775 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 795 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 794 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 854 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 777 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 783 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 754 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 784 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 777 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3252  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 798 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.970825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 771 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1941  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 676 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.891675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 751 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 758 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 761 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 782 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 761 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 780 aa  168  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 755 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 775 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 799 aa  161  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 786 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 741 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 757 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 729 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 807 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 764 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 776 aa  158  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 806 aa  156  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 771 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 738 aa  154  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 779 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 759 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 756 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 731 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  42.36 
 
 		 730 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 767 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 857 aa  146  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 722 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 767 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 732 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  26.66 
 
 		 807 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 822 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 779 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 809 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 809 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 785 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 969 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 903 aa  135  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 758 aa  133  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  25.66 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 767 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 971 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 937 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 758 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 790 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 777 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 746 aa  124  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 783 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  24.94 
 
 		 797 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  38.86 
 
 		 780 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 737 aa  121  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  39.18 
 
 		 739 aa  121  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 771 aa  120  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 796 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 896 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 763 aa  118  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 734 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 743 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 731 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  39.46 
 
 		 789 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 725 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 754 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 		 794 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 758 aa  114  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 807 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 780 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 728 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 832 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 730 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  37.62 
 
 		 764 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 840 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 790 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 766 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  34.74 
 
 		 747 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 755 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 862 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 726 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 720 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 723 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 743 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 779 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 985 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>