More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1518 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  54.76 
 
 		 873 aa  900    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  56.69 
 
 		 848 aa  960    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  54.87 
 
 		 878 aa  893    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 854 aa  1721    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  63.24 
 
 		 851 aa  1040    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  67.84 
 
 		 855 aa  1172    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  45.6 
 
 		 808 aa  620  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  42.77 
 
 		 814 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 803 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 767 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 778 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 786 aa  326  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 778 aa  318  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 790 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 835 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 790 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 800 aa  293  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 800 aa  293  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 771 aa  273  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 741 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 815 aa  235  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 832 aa  225  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 903 aa  225  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 756 aa  224  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 720 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 732 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 734 aa  220  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 773 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 769 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.1 
 
 		 755 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 815 aa  209  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 730 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 919 aa  201  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 761 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 777 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 833 aa  198  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 704 aa  197  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 765 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 771 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 796 aa  194  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 783 aa  192  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 761 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 747 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 790 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 794 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 739 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 722 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 798 aa  180  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 896 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 734 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 784 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 722 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 775 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 733 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 817 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 776 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 757 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 790 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 737 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 763 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 794 aa  171  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 792 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 726 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 784 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 743 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 730 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 717 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 753 aa  169  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 864 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 726 aa  169  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 771 aa  168  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 786 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 838 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 761 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 745 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 755 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 769 aa  165  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 773 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 749 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 771 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 780 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 741 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.89 
 
 		 747 aa  164  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 809 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 779 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 725 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 862 aa  162  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.35 
 
 		 715 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 797 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 788 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 755 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 723 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 779 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 755 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 730 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 788 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 728 aa  159  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>