More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4253 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 713 aa  1449    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 695 aa  333  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 767 aa  317  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 713 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 685 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 702 aa  303  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 718 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 700 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 737 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 733 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 703 aa  257  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 732 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 720 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 724 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 732 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.13 
 
 		 715 aa  220  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 802 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 844 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 704 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 763 aa  190  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 841 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 749 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 775 aa  187  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 818 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 734 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 726 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 751 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 753 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 771 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 747 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 790 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 759 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 757 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 769 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 808 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 737 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 759 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 712 aa  177  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 710 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 794 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 730 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 755 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 736 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 741 aa  171  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 790 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 814 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.76 
 
 		 685 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.73 
 
 		 739 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 784 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.23 
 
 		 755 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 720 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 771 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 761 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 780 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 690 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 722 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 732 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 783 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 765 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 723 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 766 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 690 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 783 aa  164  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 729 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 764 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 807 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 730 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 778 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 730 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 722 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 848 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 853 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 790 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 710 aa  160  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 851 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 790 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 742 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 778 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 803 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 764 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 746 aa  157  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 761 aa  157  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 748 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 771 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 817 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 773 aa  157  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 753 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  27.2 
 
 		 691 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 775 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 762 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 713 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 743 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 838 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 767 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 717 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 773 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 752 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 803 aa  154  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 771 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>