More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1807 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  100 
 
 		 691 aa  1388    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 		 680 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.76 
 
 		 685 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 669 aa  318  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 722 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  32.98 
 
 		 673 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 671 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 720 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.77 
 
 		 715 aa  210  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 724 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 749 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 710 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 713 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 728 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 761 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 695 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 853 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 726 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 700 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 733 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 758 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 720 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 733 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 747 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 851 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 713 aa  160  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 720 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 730 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 737 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 794 aa  158  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 767 aa  157  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 753 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 730 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 695 aa  157  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 710 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 713 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 732 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 670 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 730 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 702 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 751 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 790 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 766 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 775 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 732 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 731 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 736 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 666 aa  150  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 761 aa  150  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 767 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 687 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 780 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 685 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.31 
 
 		 748 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 690 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 711 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 778 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 726 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  27.18 
 
 		 733 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 694 aa  147  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 790 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 686 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 786 aa  144  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 784 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 704 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 802 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 722 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 778 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 690 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 694 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 776 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  28.38 
 
 		 694 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 797 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 789 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 694 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 789 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 848 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 730 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 765 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 745 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 795 aa  137  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 763 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.91 
 
 		 755 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 729 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 730 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 780 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 711 aa  134  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.41 
 
 		 739 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 744 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 717 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 729 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 750 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 759 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 766 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>