More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2701 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2701  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 822 aa  1681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 762 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.882237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3332  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23.83 
 
 		 744 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 765 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 774 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 695 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 764 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 732 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 759 aa  147  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 730 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 780 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 750 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 769 aa  144  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 713 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 783 aa  140  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 792 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 780 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 		 741 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 764 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 799 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 773 aa  131  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 758 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 783 aa  128  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 777 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 754 aa  127  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 771 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 776 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 758 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 803 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 780 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 758 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 770 aa  125  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 771 aa  125  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 761 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 758 aa  125  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 771 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 773 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 743 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 777 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 758 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 788 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 769 aa  121  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 726 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  21.24 
 
 		 809 aa  119  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 802 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 738 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 779 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 777 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 720 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  23.12 
 
 		 754 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 860 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 763 aa  114  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  22.92 
 
 		 751 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 758 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 857 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 755 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 725 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 767 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 765 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 765 aa  109  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  23.41 
 
 		 797 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 772 aa  108  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 798 aa  108  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 703 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 704 aa  106  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 732 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 700 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 726 aa  104  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 903 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 730 aa  102  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 824 aa  102  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 790 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 769 aa  101  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 807 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 829 aa  101  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 791 aa  101  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 780 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 790 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 762 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 728 aa  99  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 779 aa  99.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 731 aa  98.2  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 851 aa  98.2  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 817 aa  97.4  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 800 aa  97.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 800 aa  97.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 684 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 730 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 751 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 777 aa  96.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 803 aa  96.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 734 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 896 aa  95.9  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 726 aa  95.9  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 744 aa  95.1  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 749 aa  94.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  35.51 
 
 		 759 aa  94.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>