More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0027 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 754 aa  1519    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  47.05 
 
 		 757 aa  636    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  45.65 
 
 		 769 aa  608  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  45.67 
 
 		 738 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  43.49 
 
 		 758 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  43.55 
 
 		 731 aa  555  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  43.42 
 
 		 742 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  41.57 
 
 		 777 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  40.46 
 
 		 763 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  39.82 
 
 		 761 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 776 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 743 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 782 aa  230  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 737 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 756 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 773 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 759 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 771 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 730 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 763 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 773 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 771 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 725 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 747 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 710 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 761 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 794 aa  189  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 766 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.92 
 
 		 759 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 757 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 704 aa  186  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 780 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 767 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 731 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 755 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 730 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 743 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 771 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 746 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 784 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 808 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 790 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 789 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 789 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 713 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 767 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 761 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 784 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.87 
 
 		 739 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 743 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 784 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 734 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 736 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.35 
 
 		 755 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 765 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 722 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 748 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 779 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 741 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 747 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 758 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 792 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 785 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 755 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 763 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 794 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 797 aa  168  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 794 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.23 
 
 		 754 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 785 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 808 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 786 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  26.28 
 
 		 789 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 804 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 780 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 769 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 771 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 741 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 858 aa  163  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 758 aa  163  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 803 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 717 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.71 
 
 		 822 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 764 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 783 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 749 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 769 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 853 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 744 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 779 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 778 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 783 aa  160  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 720 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 778 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>