More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1458 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 694 aa  1397    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 693 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 687 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 690 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 690 aa  210  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 720 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 853 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 666 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 851 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.79 
 
 		 715 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 720 aa  185  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 704 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 713 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 722 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 700 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 697 aa  159  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 671 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 733 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 730 aa  156  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.87 
 
 		 685 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 734 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 670 aa  153  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 732 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 759 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 726 aa  150  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 783 aa  150  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 736 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 732 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 702 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 695 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 733 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 710 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 747 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 748 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 713 aa  145  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 779 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 757 aa  144  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 776 aa  144  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 684 aa  144  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 743 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 729 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 771 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 669 aa  140  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 724 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 765 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 731 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 710 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 743 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 717 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 730 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 764 aa  138  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 733 aa  138  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 736 aa  138  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 744 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 729 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 783 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 773 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 746 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 744 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 762 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 769 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 780 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 730 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 713 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 788 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 729 aa  134  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 720 aa  134  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 753 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 744 aa  133  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 794 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 732 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 771 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.17 
 
 		 754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 784 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 712 aa  130  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.31 
 
 		 755 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 751 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 780 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 733 aa  130  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 722 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 662 aa  130  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 688 aa  130  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 773 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 722 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 780 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 758 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  24.58 
 
 		 714 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  25.47 
 
 		 673 aa  127  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 741 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  24.53 
 
 		 733 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 732 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 695 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 755 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 763 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 725 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 758 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 737 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>