More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01003 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  47.37 
 
 		 761 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  54.64 
 
 		 731 aa  815    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  73.68 
 
 		 777 aa  1157    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  54.5 
 
 		 742 aa  785    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 758 aa  1537    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  45.47 
 
 		 757 aa  627  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  43.35 
 
 		 769 aa  601  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  45.3 
 
 		 763 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  45.13 
 
 		 776 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  41.98 
 
 		 738 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  43.78 
 
 		 754 aa  554  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 747 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 773 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 771 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 771 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 773 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 763 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 777 aa  229  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 794 aa  228  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 759 aa  225  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 773 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 725 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 762 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 862 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 720 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 783 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.93 
 
 		 741 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 704 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 783 aa  215  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 780 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 729 aa  207  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 734 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 761 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 761 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 730 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 722 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 764 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.03 
 
 		 755 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  28.03 
 
 		 797 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 789 aa  198  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 803 aa  198  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 785 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 857 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 766 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 735 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 743 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 726 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 755 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 767 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 803 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 778 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 761 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 803 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 738 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 756 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 789 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 780 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 790 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 710 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 741 aa  190  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 746 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 737 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 804 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 722 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 774 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 743 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 780 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 808 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 767 aa  186  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 782 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 759 aa  187  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 771 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 765 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 822 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 810 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 748 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 791 aa  184  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 755 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 798 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 695 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 776 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 723 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 730 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 731 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 732 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 773 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  24.82 
 
 		 809 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 750 aa  177  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 764 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 732 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 755 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 767 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 815 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>