More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03169 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  52.38 
 
 		 806 aa  795    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 797 aa  1599    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  61.13 
 
 		 786 aa  946    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  86.02 
 
 		 802 aa  1420    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  60.65 
 
 		 795 aa  959    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 763 aa  320  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 747 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 757 aa  241  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 771 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 822 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 807 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 802 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 780 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 742 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.38 
 
 		 784 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 762 aa  213  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 781 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 780 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 791 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 883 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 792 aa  204  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 753 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 734 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 808 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  26.49 
 
 		 785 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 798 aa  194  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 795 aa  194  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 795 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  25.95 
 
 		 889 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 777 aa  191  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 886 aa  184  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 788 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 875 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 847 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 712 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 777 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 		 856 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  25.2 
 
 		 846 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 766 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 804 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 904 aa  158  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 794 aa  152  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.06 
 
 		 830 aa  150  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 752 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 713 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 704 aa  147  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 769 aa  147  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 764 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 747 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 729 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 800 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 800 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 734 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 822 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 365 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 718 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 763 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 770 aa  130  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 769 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 723 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 732 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  33.98 
 
 		 801 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 771 aa  128  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 732 aa  128  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 700 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 790 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 815 aa  127  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 798 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 738 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 765 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 743 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 758 aa  124  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 724 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 780 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 743 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 702 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 746 aa  124  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  23.7 
 
 		 809 aa  124  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 732 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.26 
 
 		 739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 767 aa  123  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 735 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 731 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 703 aa  121  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 687 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.12 
 
 		 715 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 690 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 774 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 737 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 808 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 730 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 730 aa  118  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 690 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 684 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 744 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 749 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 763 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 766 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>