More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2191 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  41.4 
 
 		 1237 aa  942    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  72.92 
 
 		 1136 aa  1642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1219 aa  2493    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  56.71 
 
 		 1135 aa  1267    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  46.16 
 
 		 1114 aa  963    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  52.99 
 
 		 1219 aa  1275    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  62.57 
 
 		 1119 aa  1382    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  31.14 
 
 		 1111 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1220 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1203 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1114 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1218 aa  333  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1187 aa  325  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1161 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1122 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 1189 aa  312  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1155 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 1185 aa  307  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 1198 aa  307  9.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1198 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1132 aa  295  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 996 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1175 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 1160 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1010 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  24.57 
 
 		 1211 aa  285  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1124 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 1181 aa  284  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1205 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1128 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1152 aa  281  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 1154 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 994 aa  279  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1120 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1181 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 1204 aa  275  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1202 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 1140 aa  271  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 1023 aa  271  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 1043 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1084 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1217 aa  270  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 992 aa  268  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1102 aa  268  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1177 aa  268  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 1144 aa  267  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1008 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1062 aa  266  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1199 aa  265  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1154 aa  265  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1155 aa  264  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1079 aa  264  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1150 aa  263  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1148 aa  262  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1096 aa  261  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1053 aa  260  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1109 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1041 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 999 aa  257  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 996 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1014 aa  254  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1021 aa  254  9.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1142 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1105 aa  254  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1086 aa  253  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1116 aa  251  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  23.3 
 
 		 1229 aa  251  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1006 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1029 aa  251  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1137 aa  251  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1101 aa  251  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 1154 aa  249  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.76 
 
 		 1019 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1127 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1096 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1028 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1066 aa  246  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 1230 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 1050 aa  241  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1034 aa  240  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1189 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 1063 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1020 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 1026 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1079 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1190 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1038 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1003 aa  238  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1013 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1047 aa  237  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1173 aa  236  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1023 aa  234  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1066 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1179 aa  234  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1081 aa  234  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1064 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 1080 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1033 aa  231  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25.78 
 
 		 1041 aa  231  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1017 aa  231  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>