More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4751 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  61.07 
 
 		 806 aa  950    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  70.5 
 
 		 786 aa  1092    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  60.94 
 
 		 802 aa  943    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  62.58 
 
 		 797 aa  954    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 795 aa  1602    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 763 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 757 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 747 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 771 aa  280  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 807 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 791 aa  270  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 802 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 		 785 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 734 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 780 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 762 aa  247  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 780 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  28.37 
 
 		 822 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 889 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  29.07 
 
 		 784 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 753 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 712 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 781 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 742 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 808 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 795 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 777 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 792 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 766 aa  204  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 795 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 875 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 777 aa  197  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 798 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 883 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 846 aa  191  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 753 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 763 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 856 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 713 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 702 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 886 aa  180  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 847 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 752 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 700 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 804 aa  171  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 720 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  26.85 
 
 		 801 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 704 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 808 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  27.03 
 
 		 830 aa  165  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 788 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 904 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 803 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 734 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 766 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 751 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 794 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 729 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 769 aa  158  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 737 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 747 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 774 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 780 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 756 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 778 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 724 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 808 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 709 aa  151  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 770 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 732 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 778 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 773 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 365 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 787 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 764 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 736 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.87 
 
 		 776 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 792 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 774 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 814 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 730 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 790 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 782 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 785 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 903 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 731 aa  141  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 783 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 803 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 761 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 749 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 695 aa  139  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 757 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 779 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 800 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 800 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 741 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>