More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1080 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  44.35 
 
 		 985 aa  770    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 937 aa  1923    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 971 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  36.38 
 
 		 969 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 783 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 763 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 758 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.97 
 
 		 739 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 822 aa  189  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 867 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 761 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 804 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 803 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 769 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 761 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 748 aa  184  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 758 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 903 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 744 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 753 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 738 aa  177  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 771 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 780 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 797 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 785 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 797 aa  171  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 731 aa  171  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 859 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 733 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 860 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 742 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 731 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 783 aa  160  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 720 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 896 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 722 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 795 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 854 aa  157  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 856 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 789 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 		 755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 745 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 794 aa  154  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  25.93 
 
 		 789 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  26.74 
 
 		 889 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 767 aa  152  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 785 aa  151  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 775 aa  150  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3422  TonB-dependent receptor, plug  36.49 
 
 		 345 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209041  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 798 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  37.2 
 
 		 487 aa  149  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 700 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 702 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 		 730 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 		 763 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 764 aa  147  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  38.66 
 
 		 759 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 743 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 862 aa  145  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 756 aa  144  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 796 aa  144  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  24.47 
 
 		 807 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 919 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 757 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  38.84 
 
 		 763 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 777 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 803 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  37.05 
 
 		 737 aa  141  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 794 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 796 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 775 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 		 792 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 784 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 860 aa  138  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 765 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 724 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 795 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 853 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 723 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  37.96 
 
 		 766 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  31.56 
 
 		 715 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 780 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 729 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 777 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 728 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 713 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 802 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 851 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  24.86 
 
 		 850 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 732 aa  134  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  41.3 
 
 		 774 aa  135  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 750 aa  134  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 765 aa  134  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>